E' possibile cambiare il valore di un campo della tabella core_config_data grazie al metodo:

Mage::getConfig()->saveConfig($path, $value, 'default', 0);

dove $path è la colonna della tabella, $value è il valore nuovo del campo, 'default' e 0 impostati per il valore di default, lo store "0".

Se si volesse invece impostare il valore per uno specifico store:

Mage::getConfig()->saveConfig($path, $value, 'store', $storeID);